Если награждать соборы и церкви Зальцбурга орденами «За значимость», Францисканский храм займет уверенное второе место, уступив лишь кафедральной святыне города. Строгое готическое здание церкви, дополненное барочным и романским стилем, не имеет пестрых красок, вместо которых повсюду видны приглушенные серые оттенки. Световые окна с особым расположением фильтруют проникающий свет, позволяя в деталях рассмотреть звездный свод и каждую настенную роспись. Главным украшением алтаря является фигура Богородицы с Младенцем, а также изваяния святых Руперта и Вергилия. Туристические экскурсии в церковь возможны только после богослужений, когда отгремит органная музыка и божественные гимны умолкнут, затерявшись где-то между колонн.